흠...
이상하네요...

저희 EZBOARD-M01 하우투 문서에서 보면 ( 페이지 77 )
CD 에 있는 rpm을 이용하면

/usr/arm-linux 로 설치되는 데요.

어떤 강좌를 참조하신거죠?

그리고 /usr/local/arm-linux 로 설치되었다면
말씀하신 대로 하셔야 합니다.
하지만 헤더화일에 이상이 있다고 나오는 것은 조금 이상하군요

arm-linux-gcc -print-search-dirs

명령을 사용하면 gcc가 참조하는 디렉토리 목록이 나옵니다.
한번 살펴 보세요