소프트웨어적인 부분과 하드웨어적인 부분을 모두 보셔야 합니다.

소프트웨어적인 것은 메모리 억세스 속도에 관련된 처리가
IDE 버스 규격에 맞도록 했는지를 검토해야 하고요
(IDE 버스가 의외로 조금 느리죠 )

하드웨어적인 부분은 해당 버스 신호들이 정확하게 나오는가를
보아야 합니다.

아무래도 오실로 스코프를 갖다 되시는 것이 가장 좋은 방법일듯 보입니다.